Linnugripp ja Newcastle`i haigus

Haiguste tutvustused:

 

ANALÜÜSIMEETODID

Tekitaja uuringud	Meetod	Uurimismaterjal	Metoodika	Osakond
Lindude gripi viiruse (M, H5, H7 ja/või N1 geenide) määramine	Real-time RT-PCR	Kuiv kloaagi-tampooniproov Lindude organid: kopsud ja trahhea Allantoisi vedelik	5MA-TJ-63	Molekulaaranalüüs
Lindude gripi, sigade gripi ja hobuste gripi  M geeni määramine			5MA-TJ-67*
Lindude gripi viiruse N8 geeni määramine			5MA-TJ-71*
Lindude gripi viiruse N6 geeni määramine			5MA-TJ-89*
Lindude paramüksoviirus-1 (APMV-1) ehk Newcastle haiguse viiruse L geeni määramine		Lindude organid: kops, neer põrn, aju, maks süda, soolestik Kloaagi-tampooniproov Allantoisivedelik	5MA-TJ-3
Lindude Newcastle viiruse patotüpiseerimine	Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs	Newcastle viiruse L geeni suhtes positiivseks määratud proovi RNA	5MA-TJ-10*
Lindude gripi viiruse patotüpiseerimine		Lindude gripi viiruse M geeni suhtes positiivseks määratud proovi RNA	5MA-TJ-12*
Newcastle haiguse viiruse isoleerimine ning identifitseerimine	Viiruse isoleerimine (VI) ja identifitseerimine	Ninanõre Trahhea nõre Kloaagitampooni proov Organite suspensioon	5DV-TJ69	Viroloogia-seroloogia
Lindude gripi viiruse isoleerimine ning identifitseerimine			5DV-TJ-70

 * meetod akrediteerimata 

Antikeha uuringud	Meetod	Uurimismaterjal	Metoodika	Osakond
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramine	Hemaglutinatsiooni inhibitsiooni (HAI) testiga	Seerum Plasma.	5DV- TJ65	Viroloogia-seroloogia
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramise	ELISA		5DV- TJ66
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine	HAI		5DV- TJ67
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine	ELISA		5DV- TJ68

Analüüsimeetod viiruse tuvastamiseks (VI ja/või PCR) valitakse sõltuvalt uuringu eesmärgist. Haiguskahtluse ja/või ebaselge uurimistulemuse puhul teostatakse alati ka viiruse tuvastamise teise analüüsimeetodiga.                                                                                                                                                             

ANALÜÜSE TEOSTAV LABORATOORIUM
Kreutzwaldi 30, Tartu

PROOVIDE VÕTMINE, SÄILITAMINE JA SAATMINE
Proovide võtmine teostatakse võimalikult puhtalt.

Surmajärgselt võetavad proovid 

• Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov
• Organproovid: ajukude, trahhea, kops, põrn, maks ja seedetrakt. 

Elupuhuselt võetavad proovid 

• Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov või roojaproov. 
• Tampooniproovid võtta steriilse tampooniga, panna katsutisse. 

Proovivõtu tampoone väljastab Veterinaar- ja Toidulaboratooriumi Tartu labor. 

Proovide pakkimine 

• Iga linnu proovid pakkida eraldi puhtasse taarasse (nt plastkott, võimalusel kasutada soonsulguriga (minigrip) või traadiga suletavat plastkotti). 
• Sooled ja seedetrakti sisu pakkida eraldi taarasse, et välistada nende kokkupuudet siseorganitega.
• Proov pakitakse lekkekindlalt. Eriti oluline on, et väline pakkematerjal on saastumata ning puhas. 
• Iga pakend märgistatakse loetavalt. 

Proovide laborisse saatmine ja säilitamine

• Organproovid ja korjused toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures maksimaalselt 2 päeva või pikemaajaliselt -20 °C juures. 
• Tampooniproovid toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures. 

Kaaskiri ja laboratooriumi teavitamine

• Koos proovidega saadetakse laborisse korrektselt täidetud ja piisavalt infot sisaldav kaaskiri, mille leiab VTL-i kodulehelt tellimuste vormid alt. Oluline on märkida kaaskirjale proovi võtmise täpne kuupäev ja kellaaeg.

ANALÜÜSI TEOSTAMISE AEG
Real-time RT-PCR: kuni 5 tööpäeva 
Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs: kuni 10 tööpäeva
VI ja identifitseerimine: kuni 21 päeva
HAI: kuni 14 tööpäeva
ELISA: kuni 5 tööpäeva 

Epideemia puhangu tingimustes võivad analüüside teostamise ajad pikeneda.

ANALÜÜSIMEETODID
Real-time RT-PCR: reaalaja pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon 
Konventsionaalne RT- PCR ja sekventsanalüüs: konventsionaalne pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon ja sekventsanalüüs
VI ja identifitseerimine: viiruse isoleerimine ja identifitseerimine
ELISA: ensüüm-immuunsorbtsiooni meetod
HAI: hemaglutinatsiooni inhibitsiooni test

TÄIENDAV INFO JA KONTAKTID 
•    Viroloogia-seroloogia osakond. Info telefonil 738 6111 või 50 66 687
•    Molekulaaranalüüsi osakond. Info telefoni 738 6121 
     
Koostatud: 18.12.2019
Koostanud: Triin Tedersoo