Linnugripp ja Newcastle`i haigus
Haiguste tutvustused:
ANALÜÜSIMEETODID
Tekitaja uuringud |
Meetod |
Uurimismaterjal |
Metoodika |
Osakond |
Lindude gripi viiruse (M, H5, H7 ja/või N1 geenide) määramine |
Real-time RT-PCR |
|
5MA-TJ-63 |
Molekulaaranalüüs |
Lindude gripi, sigade gripi ja hobuste gripi M geeni määramine |
5MA-TJ-67* |
|||
Lindude gripi viiruse N8 geeni määramine |
5MA-TJ-71* |
|||
Lindude gripi viiruse N6 geeni määramine |
5MA-TJ-89* |
|||
Lindude paramüksoviirus-1 (APMV-1) ehk Newcastle haiguse viiruse L geeni määramine |
|
5MA-TJ-3 |
||
Lindude Newcastle viiruse patotüpiseerimine |
Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs |
|
5MA-TJ-10* |
|
Lindude gripi viiruse patotüpiseerimine |
|
5MA-TJ-12* |
||
Newcastle haiguse viiruse isoleerimine ning identifitseerimine |
Viiruse isoleerimine (VI) ja identifitseerimine |
|
5DV-TJ69 |
Viroloogia-seroloogia
|
Lindude gripi viiruse isoleerimine ning identifitseerimine |
5DV-TJ-70 |
* meetod akrediteerimata
Antikeha uuringud |
Meetod |
Uurimismaterjal |
Metoodika |
Osakond |
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramine |
Hemaglutinatsiooni inhibitsiooni (HAI) testiga |
|
5DV- TJ65 |
Viroloogia-seroloogia
|
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramise |
ELISA |
5DV- TJ66 |
||
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine |
HAI |
5DV- TJ67 |
||
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine |
ELISA |
5DV- TJ68 |
Analüüsimeetod viiruse tuvastamiseks (VI ja/või PCR) valitakse sõltuvalt uuringu eesmärgist. Haiguskahtluse ja/või ebaselge uurimistulemuse puhul teostatakse alati ka viiruse tuvastamise teise analüüsimeetodiga.
ANALÜÜSE TEOSTAV LABORATOORIUM
Kreutzwaldi 30, Tartu
PROOVIDE VÕTMINE, SÄILITAMINE JA SAATMINE
Proovide võtmine teostatakse võimalikult puhtalt.
Surmajärgselt võetavad proovid
- Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov
- Organproovid: ajukude, trahhea, kops, põrn, maks ja seedetrakt.
Elupuhuselt võetavad proovid
- Igalt uuritavalt linnult võetakse proov steriilse tampooniga ja pannakse katsutisse.
- Koondada võib viie linnu tampooniproovid ühte katsutisse.
- Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov või roojaproov.
- Tampooniproovid võtta steriilse tampooniga, panna katsutisse.
Proovivõtu tampoone väljastab Veterinaar- ja Toidulaboratooriumi Tartu labor.
Proovide pakkimine
- Iga linnu proovid pakkida eraldi puhtasse taarasse (nt plastkott, võimalusel kasutada soonsulguriga (minigrip) või traadiga suletavat plastkotti).
- Sooled ja seedetrakti sisu pakkida eraldi taarasse, et välistada nende kokkupuudet siseorganitega.
- Proov pakitakse lekkekindlalt. Eriti oluline on, et väline pakkematerjal on saastumata ning puhas.
- Iga pakend märgistatakse loetavalt.
Proovide laborisse saatmine ja säilitamine
- Organproovid ja korjused toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures maksimaalselt 2 päeva või pikemaajaliselt -20 °C juures.
- Tampooniproovid toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures.
Kaaskiri ja laboratooriumi teavitamine
- Koos proovidega saadetakse laborisse korrektselt täidetud ja piisavalt infot sisaldav kaaskiri, mille leiab VTL-i kodulehelt tellimuste vormid alt. Oluline on märkida kaaskirjale proovi võtmise täpne kuupäev ja kellaaeg.
ANALÜÜSI TEOSTAMISE AEG
Real-time RT-PCR: kuni 5 tööpäeva
Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs: kuni 10 tööpäeva
VI ja identifitseerimine: kuni 21 päeva
HAI: kuni 14 tööpäeva
ELISA: kuni 5 tööpäeva
Epideemia puhangu tingimustes võivad analüüside teostamise ajad pikeneda.
ANALÜÜSIMEETODID
Real-time RT-PCR: reaalaja pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon
Konventsionaalne RT- PCR ja sekventsanalüüs: konventsionaalne pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon ja sekventsanalüüs
VI ja identifitseerimine: viiruse isoleerimine ja identifitseerimine
ELISA: ensüüm-immuunsorbtsiooni meetod
HAI: hemaglutinatsiooni inhibitsiooni test
TÄIENDAV INFO JA KONTAKTID
• Viroloogia-seroloogia osakond. Info telefonil 738 6111 või 50 66 687
• Molekulaaranalüüsi osakond. Info telefoni 738 6121
Koostatud: 18.12.2019
Koostanud: Triin Tedersoo